כצוות הניהול המרכזי של הסוכנות היהודית לישראל, הנהגתנו הבכירה – בשיתוף עם חבר הנאמנים – אחראית על ההתנהלות הפנימית של הסוכנות היהודית. חברי ההנהלה מפקחים על תקציבים, מנהלים פעולות וממליצים על עדכוני מדיניות ויוזמות, ומחליטים על תוכניות הסוכנות היהודית בשיתוף פעולה מלא עם ממשלת ישראל.